龙8long8,研究用单细胞基因组学揭示DCIS进展过程中持续亚克隆畸变—小柯机
美国德州大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin研究组,利用档案单细胞基因组学揭示了导管原位癌(DCIS)进展过程中持续的亚克隆突变。2023年8月15日出版的《细胞》杂志发表了这项成果。龙8网页版登录官网
他们开发了Arc-well,一种与FFPE材料兼容的高通量单细胞DNA测序方法。他们通过分析来自细胞系、冷冻组织的40330个单细胞,以及保存3-31年的乳腺、肺和前列腺肿瘤的27个FFPE样本来验证他们的方法。对10例匹配DCIS和2-16年后复发的癌症患者的分析表明,许多原发性DCIS已经经历了全基因组加倍和克隆多样化,并且他们与复发的持续性亚克隆具有相同的基因组谱系。
进化分析表明,在他们的队列中龙8long8,大多数DCIS病例经历了进化瓶颈龙8long8,并进一步确定了与复发相关的持续亚克隆中的染色体畸变。
据了解,DCIS是浸润性乳腺癌的常见前兆。人们对其基因组进展到复发性疾病的理解仍然很差,龙8网页版登录官网部分原因是与福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)材料的基因组分析相关的挑战。