和肝细胞癌而导致死亡。尽管抗病毒治疗，如核苷类似物和干扰素的联合使用，广泛应用于CHB患者，但这些治疗方法无法根除病毒，实现CHB的功能性治愈仍然是一个巨大的挑战。除此之外龙8long8，肝内炎症的形成机制尚不完全清楚，而

　　该研究旨在通过整合肝脏的整体转录组数据、单细胞测序数据和临床数据，从多组学角度分析导致CHB肝内炎症形成的因素。

　　研究团队开发了一个贝叶斯线性模型，将基因表达与临床参数联系起来，并更新了特定细胞类型的表达分析（PSEA），以在不同临床阶段将整体基因表达分解为特定细胞类型。这种多组学整合的方法可以帮助我们揭示CHB肝内炎症的细胞和分子机制，为未来的诊断和治疗提供新的见解（图1）。

　　研究团队选取了82名CHB患者，根据HBeAg状态、HBV血清载量和血清ALT水平，将患者分为四个临床阶段：HBeAg阳性慢染、HBeAg阳性慢性肝炎、HBeAg阴性慢染和HBeAg阴性慢性肝炎。对肝活检样本进行的组织学检查排除了脂肪肝和其他肝病患者。

　　主成分分析（PCA）显示，CHB患者肝内基因表达谱在慢性肝炎阶段显著上调，特别是与免疫过程相关的基因富集。基因集富集分析（GSEA）揭示了多种已知的肝损伤途径，如细胞凋亡、焦亡、坏死和自噬性细胞死亡的上调。（见图2）

　　GSEA分析：显示多种与免疫和炎症相关的基因在慢性肝炎阶段上调，如细胞因子、趋化因子和干扰素刺激基因（ISGs）。

　　（该图展示了基于单细胞 RNA 测序数据的肝脏中细胞类型特异性标记基因，龙8登录揭示了与免疫过程相关的基因富集。图中还包括了与肝损伤相关的途径，如细胞凋亡、焦亡、坏死和自噬性细胞死亡的上调情况。）

　　研究合并并标准化了来自人类肝脏的三组10×基因组单细胞RNA测序数据，映射并可视化了13种细胞类型。通过UMAP方法，将这些细胞类型如肝细胞、胆管细胞、T细胞、B细胞和巨噬细胞等进行展示和分析。 （见图3）

　　通过UMAP方法分析了单细胞RNA测序数据，识别并可视化了肝脏中的13种细胞类型，包括肝细胞、胆管细胞、T细胞、B细胞和巨噬细胞。每种细胞类型都有特异性的标记基因，如肝细胞的ALB、胆管细胞的KRT19、T细胞的CD3D、B细胞的CD79A和巨噬细胞的CD68。

　　（该图展示了三组10×基因组单细胞RNA测序数据的UMAP分析结果，识别出13种肝脏细胞类型。每种细胞类型都通过特异性标记基因进行标识，如肝细胞的ALB、胆管细胞的KRT19、T细胞的CD3D、B细胞的CD79A和巨噬细胞的CD68。）

　　T细胞、NK细胞、成熟B细胞和巨噬细胞在肝炎阶段的肝样本中表达显著上调。血清ALT水平与大多数T细胞和巨噬细胞标记基因呈正相关，而肝细胞标记基因则呈负相关。（见图4）

　　研究发现，T细胞、NK细胞、成熟B细胞和巨噬细胞在肝炎阶段的表达显著上调，血清ALT水平与这些细胞的标记基因呈正相关，表明它们在肝损伤中起重要作用。相反，肝细胞标记基因与ALT水平呈负相关。

　　（该图展示了在肝炎阶段，T细胞、NK细胞、成熟B细胞和巨噬细胞的标记基因表达显著上调，血清ALT水平与这些细胞标记基因呈正相关龙8long8，而肝细胞标记基因则呈负相关，表明这些免疫细胞在肝损伤中的重要作用。）

　　研究通过PSEA模型分析，发现趋化因子如CCL20和CXCL8主要由巨噬细胞和T细胞表达，这些基因与ALT水平呈显著正相关，表明其在肝损伤中的重要作用。（见图5、6）

　　此外，免疫耗竭标记基因如PDCD1（编码PD-1）和HAVCR2（编码TIM-3）在肝炎阶段上调，提示免疫细胞在慢性肝炎中的功能耗竭。

　　（该图展示了通过PSEA模型分析的结果，龙8登录趋化因子如CCL20和CXCL8主要由巨噬细胞和T细胞表达，这些基因与ALT水平呈显著正相关。此外，免疫耗竭标记基因如PDCD1（编码PD-1）和HAVCR2（编码TIM-3）在肝炎阶段上调，提示免疫细胞在慢性肝炎中的功能耗竭。）

　　研究分析显示，79个ISGs在肝炎阶段上调，其中包括STAT1、STAT2、ISG15、ISG20等。通过PSEA模型，发现T细胞和巨噬细胞主要贡献了这些基因的表达，而B细胞和肝细胞的ISGs表达则与ALT水平无显著相关。（见图7、8）

　　研究发现，79个ISGs在肝炎阶段显著上调，包括STAT1、STAT2、ISG15和ISG20。这些基因主要由T细胞和巨噬细胞表达，表明干扰素信号在肝炎中的重要作用。相较之下，B细胞和肝细胞的ISGs表达与ALT水平无显著相关。

　　（该图展示了79个干扰素刺激基因（ISGs）在肝炎阶段显著上调的情况，包括STAT1、STAT2、ISG15和ISG20。通过PSEA模型分析，T细胞和巨噬细胞主要贡献了这些基因的表达，显示出干扰素信号在肝炎中的重要作用。）

　　1、多组学整合分析：通过整合肝脏的整体转录组数据、单细胞测序数据和临床数据，从多组学角度全面分析CHB肝内炎症形成的机制。

　　2、细胞类型特异性表达分析：通过PSEA模型，将整体基因表达分解为特定细胞类型，揭示了不同细胞类型在肝损伤中的特定作用。

　　3、趋化因子与ISGs的关键作用：发现趋化因子如CCL20和CXCL8在肝损伤中的重要作用，以及特定ISGs在肝炎阶段的上调，揭示了其在肝损伤中的潜在机制。这些基因的显著上调和表达模式的变化提供了关于CHB肝内炎症形成的新见解，可能成为未来治疗的潜在靶点。

　　本研究通过多组学整合分析，揭示了慢性乙型肝炎肝内炎症形成的关键因素。研究表明，特定细胞类型在肝损伤中的作用，以及趋化因子和干扰素刺激基因在肝炎中的上调，提供了关于肝炎机制的深刻见解。通过了解这些基因和细胞类型在CHB中的具体作用，未来可以开发更有效的诊断工具和治疗策略，以改善CHB患者的预后。